Отладчик параллельных программ для ОС Linux
https://doi.org/10.15514/ISPRAS-2020-32(4)-7
Аннотация
В статье представлен отладчик параллельных программ, написанных на языкe программирования Си/Си++ или Фортране, которые предназначены для выполнения на высокопроизводительных вычислительных системах. В работе раскрывается схема взаимодействия компонентов отладчика параллельных программ, представлен алгоритм обработки результатов профилирования программы с помощью встроенных средств профилирования. Описаны возможности графического интерфейса пользователя и отладчика в целом. В статье рассказано о развитии отладчика параллельных программ, в частности о реализации коммуникационной древовидной схемы соединения его компонентов между собой, о режиме неинтерактивной отладки, о поддержке графических ускорителей корпорации Nvidia.
Об авторах
Алексей Борисович КИСЕЛЕВ
Российский федеральный ядерный центр –
Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной физики
Россия
кандидат физико-математических наук, начальник лаборатории разработки системного программного обеспечения
Россия
кандидат физико-математических наук, начальник лаборатории разработки системного программного обеспечения
Сергей Николаевич КИСЕЛЕВ
Российский федеральный ядерный центр –
Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной физики
Россия
старший научный сотрудник
Россия
старший научный сотрудник
Список литературы
1. TotalView. URL: https://totalview.io/free-trial, 12.03.2020.
2. Distributed Debugging Tool. URL: https://www.arm.com/products/development-tools/server-and-hpc/forge/ddt, 12.03.2020.
3. Eclipse Parallel Tools Platform. URL: http://eclipse.org/ptp, 12.03.2020.
4. Федоров В.К., Киселев С.Н. Отладчик параллельных приложений (PDB). Вопросы атомной науки и техники. Серия «Математическое моделирование физических процессов», вып. 3, 2013 г., стр. 65-71. // Fedorov V.K, Kiselev S.N. A debugger of parallel applications (PDB). Voprosy Atomnoy Nauki i Tekhniki. Series «Mathematical modelling of physical processes», issue 3, 2013, pp.65-71 (in Russian).
5. Malyshkin V. E, Romanenko A.A. GEPARD – General Parallel Debugger for MVS-1000/M. Lecture Notes in Computer Science, vol. 2763, 2003, pp.519-523.
6. Андрианов А.Н., Базаров С.Б., Бугеря А.Б., Колударов П.И., Набоко И.М. Применение отладчика параллельных программ при решении задачи о фокусировке ударных и взрывных волн на многопроцессорных ЭВМ. Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, № 50, 2004 г., 15 стр. / Andrianov A.N., Bazarov S.B., Bugerya A.B., Koludarov P.I., Naboko I.M. Application of parallel programs debugger for multiCPU modeling of shock and blast waves focusing. Keldysh Institute preprints, № 50, 2004, 15 p.
7. Киселев А.Б., Киселев С.Н., Семенов Г.П. Отладчик параллельных программ для кластеров на базе ОС Linux. Вопросы атомной науки и техники. Серия «Математическое моделирование физических процессов», 2018 г., вып. 2, стр. 72-80. // Kiselev A.B., Kiselev S.N. A parallel debugger for clusters on the base of OS Linux. Voprosy Atomnoy Nauki i Tekhniki. Series «Mathematical modelling of physical processes», issue 2, 2018, pp.72-80 (in Russian).
8. GDB. URL: http://www.gnu.org/software/gdb, 12.03.2020.
9. Torque. URL: http://www.adaptivecomputing.com/products/open-source/torque, 12.03.2020.
10. SLURM. URL: https://slurm.schedmd.com/documentation.html, 12.03.2020.
11. Киселев А.Б, Киселев С.Н. Система пакетной обработки заданий JAM. Вопросы атомной науки и техники. Серия «Математическое моделирование физических процессов», 2009 г., вып. 4, стр. 60-66. / Kiselev A.B., Kiselev S.N. JAM batch jobs system. Voprosy Atomnoy Nauki i Tekhniki. Series «Mathematical modelling of physical processes», issue 4, 2009, pp. 60-66 (in Russian).
12. Google Performance Tools. URL: https://github.com/gperftools/gperftools, 12.03.2020.
13. mpiP: Lightweight, Scalable MPI Profiling. URL: http://mpip.sourceforge.net, 12.03.2020.
14. SwingX. URL: https://github.com/arotenberg/swingx, 12.03.2020.
15. JHDF5. URL: http://www.hdfgroup.org, 12.03.2020.
16. Jzy3D. URL: http://www.jzy3d.org, 12.03.2020.
17. RSyntaxTextArea. URL: http://www.sorceforge.org/rsyntaxtextarea, 12.03.2020.
18. OpenGL. URL: https://www.opengl.org/sdk/libs/, 12.03.2020.
19. CUDA Toolkit Documentation. URL: http://docs.nvidia.com/cuda/eula/index.html, 12.03.2020.
20. Кульнев Д.В., Модянов Р.В., Петрик А.Н. Защищенная ОС. Открытые системы. СУБД, № 4, 2015 г. / Kulnev D.V., Modjanov R. V, Petrik A.N. Secured OS. Open systems. DBMS, № 4. 2015 (in Russian).
21. Петрик А.Н. Защищенная операционная система Арамид для супер-ЭВМ. Сборник тезисов докладов Национального суперкомпьютерного форума (НСКФ-2019), 2919 г. / Petrik A.N. Secured OS Aramid for the super-computer. In Proc. of the National Supercomputer Forum (NSCF-2019), 2019 (in Russian).
Рецензия
Для цитирования:
КИСЕЛЕВ А.Б., КИСЕЛЕВ С.Н. Отладчик параллельных программ для ОС Linux. Труды Института системного программирования РАН. 2020;32(4):97-114. https://doi.org/10.15514/ISPRAS-2020-32(4)-7
For citation:
KISELEV A.B., KISELEV S.N. A debugger of parallel programs for OS Linux. Proceedings of the Institute for System Programming of the RAS (Proceedings of ISP RAS). 2020;32(4):97-114. (In Russ.) https://doi.org/10.15514/ISPRAS-2020-32(4)-7
Послать статью по эл. почте 